CDX-2是一種由311個氨基酸組成的蛋白質，是一種腸特異的轉錄因子，與腸上皮分化有關，在腸道發育的早期表達，調節十二指腸到直腸的腸上皮細胞的增值和分化，定位于腸上皮絨毛和隱窩表面。高表達于十二指腸、結腸及直腸，特異性強。結直腸癌常表現為彌漫核陽性，低分化的結直腸癌常出現缺失表達。在部分伴有錯配修復基因異常的結腸癌中表達明顯下降。在74%的胃癌表現為CDX2陽性。正常食管上皮陰性，Barrett食管時強陽性。卵巢粘液性腫瘤，尤其是腸型粘液性腫瘤中CDX2也可為陽性。CDX2對于神經內分泌癌的特異性不高，胃腸道和胃腸道外的神經內分泌癌均顯示大約40%的陽性率。由于膀胱腺癌來自腸臍尿管，因此CDX2的陽性率非常高。卵巢內膜樣腺癌中很少表達，少數前列腺癌也表達CDX2。CDX2染色強度和范圍也是非常重要的。CDX2在腸癌中染色幾乎所有的細胞都是強陽性，在肝臟腺癌中部分細胞陽性，而且是有強有弱。

聯合Villin用于鑒別結直腸腺癌與轉移性腺癌。